13 октября 1941 г. Калуга пала нацистам. При отступлении из города Советы не смогли разрушить инфраструктуру города, и поэтому он попал в руки врага. Нацисты смогли наладить электроснабжение города и печатать пропагандистские материалы в городской типографии.
Еврейское гетто также было организовано в городе для чуть более 150 евреев, проживающих в городе. Оккупация продлилась недолго, и город был освобожден
30 декабря 1941 года во время Калужской операции битвы под Москвой. При отступлении из города нацисты сожгли много домов, оставив многих горожан без крова.
В 1944 году Калуга стала административным центром Калужской области.